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Soutenance de thèse de Killian Laurent

Amphithéâtre Camille Moule, campus de Rennes

Étude de la variabilité intra/interspécifique et évaluation du risque d’installation d’un nématode émergent tropical, Meloidogyne graminicola, sur culture d’importance majeure en France

Thèse co-dirigée par Laurent Folcher, UMR "Institut de Génétique Environnement et Protection des Plantes" (IGEPP) et Maira Grossi de Sa, Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation de l'environnement et du travail (Anses)

Spécialité : Biologie et agronomie

Résumé

Récemment, Meloidogyne graminicola, un nématode phytoparasite du riz en Asie, a été découvert en Italie. L’objectif de ces travaux est d’anticiper, surveiller et limiter son éventuelle implantation et dissémination en France. Le premier volet de la thèse évalue l’agressivité de différentes populations de M. graminicola pour anticiper son impact potentiel sur les cultures françaises. Les données obtenues montrent que les populations asiatiques sont plus agressives que l’italienne, bien que cette dernière puisse infecter des variétés de riz cultivées en Camargue. Les résultats sur le blé révèlent que cette culture pourrait aussi constituer un hôte possible, remettant en question les rotations riz-blé camarguaises. Le deuxième volet évalue l’intérêt des phénomènes de compétition pour limiter une potentielle invasion de M. graminicola. L’étude de ces phénomènes repose sur la compréhension des interactions de M. graminicola avec les communautés de nématodes phytoparasites natifs français. Les résultats montrent que des nématodes endoparasites (Pratylenchus) sont susceptibles d’engager des compétitions pour les ressources. Ces nématodes pourraient servir d’indicateurs évaluant la résistance des communautés natives face à M. graminicola, apportant une application directe en gestion des risques. Le dernier volet de la thèse s’est enfin attaché à rechercher des marqueurs moléculaires microsatellites capables de différencier M. graminicola d’espèces proches. Les résultats ont ainsi permis d’identifier des microsatellites prometteurs pour le développement futur d’un outil de détection optimisant la surveillance de M. graminicola et pouvant enrichir le panel d’outils déjà existants.

Mots clés : Meloidogyne graminicola, évaluation du risque, relation hôtes-parasites, régulations biologiques, O. satyva, T. aestivum