Agriculture • Alimentation • Environnement

Volume horaire : 25.00 heures

Enseignant(s) responsable(s) : F. Baron

Langue d'enseignement : Français

Objectifs :

Donner aux étudiants les bases de la microbiologie alimentaire et les former à l’analyse microbiologique en agro-alimentaire.

Contenu de l'enseignement :

Cours (12h) :

• Principes des analyses microbiologiques des aliments et des surfaces et matériels entrant en contact avec l’aliment lors de sa préparation, le cadre réglementaire de ces analyses, leurs interprétations, leurs rôles en industries agroalimentaires pour garantir la sécurité sanitaire et améliorer la qualité des aliments. 
• Lien entre les analyses microbiologiques, la qualité microbiologique des aliments, la réglementation et les différents normes et référentiels de qualité sanitaire des aliments.
• Outils qualité (résolution de problème, diagramme d’Ishikawa, audit, etc…)

TD (12h) :

• Analyses microbiologiques d’aliments et de surfaces par des méthodes de références et des techniques rapides. Ils seront amenés à interpréter les résultats pour savoir si l’aliment est d’une qualité satisfaisante et s’il respecte la réglementation en vigueur.
• Validation du nettoyage et désinfection des surfaces par le contrôle microbiologique

Modalités d'évaluation :

Évaluation écrite finale (1h)

Volume horaire : 25.00 heures

Enseignant(s) responsable(s) : S. Gouin

Langue d'enseignement : Français

Objectifs :

L’objectif de cet UC est de donner, dans une première partie, les grandes bases du marketing agroalimentaire.

Contenu de l'enseignement :

Cours (24h) :

• Évolution du marketing agro-alimentaire, les concepts, démarche et outils
• Marketing stratégique : segmentation, ciblage et positionnement
• Marketing opérationnel : politiques de produit, de prix, de distribution et de communication
• Étude de cas d’application

Modalités d'évaluation :

Contrôle écrit (1h)

Volume horaire : 48.00 heures

Enseignant(s) responsable(s) : J.-M. Fraslin

Langue d'enseignement : Français

Objectifs :

Cette UC doit permettre aux étudiants d’appréhender différentes méthodologies expérimentales en biologie : culture cellulaire, clonage, quantification de l’expression de gènes, etc. Le choix de ces méthodes s’est porté sur leur universalité : ces approches sont applicables dans différents champs disciplinaires et thématiques, fondamentaux et appliqués. 

Contenu de l'enseignement :

Cours (10h) :

• Concepts théoriques et applications en recherche fondamentales et appliquées (méthodes de sous- ou sur-expression de gènes, modèles in-vivo, ex-vivo, applications) 

Travaux Pratiques (38h) :

• Clonage de gène, Culture cellulaire (eucaryote), Transfert de gène, RTPCRq

NB : Les TP utilisant des cellules vivantes, les étudiants sont informés du fait qu’ils devront parfois travailler en dehors des heures à l’emploi du temps. 

Modalités d'évaluation :

50 % Bonnes pratiques de laboratoire + 50 % Analyse d’articles et rédaction (sous forme de projet) de parties d’articles scientifiques à partir des données expérimentales.

Volume horaire : 50.00 heures

Enseignant(s) responsable(s) : L. Montagne, M. Kouba

Langue d'enseignement : Français

Objectifs :

• Comprendre le fonctionnement des ateliers « animaux » au sein d’une exploitation agricole, en lien avec les spécificités physiologiques des espèces d’intérêts
• Analyser et faire un diagnostic du fonctionnement de ces ateliers, afin de proposer des pistes d’évolution

Contenu de l'enseignement :

Les enseignements présentent des outils de gestion de l’information en élevage, de diagnostic et de conseil. Les données issues d’ateliers seront analysées lors de séances de travaux dirigés et permettront d’établir un diagnostic du fonctionnement de ces ateliers.
L’enseignement est organisé par type d’atelier d’élevages : bovins laitiers, bovins allaitants, porcs, volailles (chair et pondeuses)…
Les principes et bases théoriques sont abordés sous forme de cours et/ou de ressources en ligne.
Une ou plusieurs visites d’élevage viendront illustrer ces approches. Des études de cas appuieront les concepts développés dans le module.

Modalités d'évaluation :

Examen écrit individuel (2 h)

Volume horaire : 25.00 heures

Enseignant(s) responsable(s) : F. Hamelin

Langue d'enseignement : Français

Objectifs :

À partir de l’analyse de cas d’espèces et d’exemples concrets, il s’agit de proposer une introduction et de présenter quelques outils pour la modélisation en général et en biologie des populations en particulier. L’objectif est de sensibiliser l’élève ingénieur à l’intérêt de ce type d’approche pour aborder des questions fondamentales comme appliquées.
La démarche pédagogique repose sur une mise en situation en faisant une place importante à des Travaux Dirigés sur informatique. 

Contenu de l'enseignement :

Le programme d'enseignement est articulé autour des thématiques suivantes :

• Notion de systèmes dynamiques,
• Introduction à l’élaboration et à l’analyse de systèmes dynamiques en écologie,
• Ajustement d’un modèle à des données

Modalités d'évaluation :

Oral de restitution d’un travail d’analyse d’article scientifique

Volume horaire : 25.00 heures

Enseignant(s) responsable(s) : F. Hamelin, C. Le May

Langue d'enseignement : Français

Objectifs :

L’objectif est de montrer, au travers de l’étude des cycles de vie des agents pathogènes, comment formaliser les processus épidémiologiques permet de raisonner la protection des populations, tant animales que végétales. Aussi, les principes de mesure et de suivi des dynamiques épidémiologiques seront présentés. 

Contenu de l'enseignement :

• Eléments d’épidémiologie : latence, incubation, période infectieuse, et leurs mesures en conditions contrôlées
• Concepts : seuil épidémiologique, immunité de groupe, théorie de la vaccination
• Propagation spatiale des maladies et simulations in silico à l’échelle de la population sur la base des mesures réalisées en laboratoire à l’échelle de l’individu 

Modalités d'évaluation :

Oral de restitution d’un travail interdisciplinaire ou d’analyse d’article