Agriculture • Alimentation • Environnement

Volume horaire : 24.00 heures

Enseignant(s) responsable(s) : C. Largouët

Langue d'enseignement : Français

Objectifs :

• Compréhension des différents types de données, de leur représentation, de leur qualité
• Structurer les informations dans des bases de données
• Interrogation des bases de données à l’aide de requêtes efficaces
• Comprendre les avantages et les limites de l’utilisation de l’IA avec des cas d’utilisation en agroécologie

Pré-requis :

Aucun

Contenu de l'enseignement :

• Le monde des données, le big data - Cours (3h)
• Concevoir des bases de données; Les interroger à l’aide de requêtes - Cours (4h), Travaux Dirigés (8h)
  ( 2 TD en 1/3 promo, 2 TD en 1/6 promo) 
• Introduction à l’Intelligence Artificielle - Cours (4h), Travaux Dirigés (4h)
  ( 2 TD en 1/6 promo)

Modalités d'évaluation :

1 évaluation en contrôle continu + Examen (1h)

Volume horaire : 25.00 heures

Enseignant(s) responsable(s) : D. Causeur

Langue d'enseignement : Anglais

Objectifs :

In many scientific issues, especially in biostatistics, marketing or consumer studies, predicting a group membership raises many statistical challenges: how to learn a classification rule from data? how to assess the risk of a misclassification error? how to avoid optimism bias in the assessment of the prediction performance? The course provides elements to answer these questions. 

By the end of this course, students will be able to:

• Implement statistical methods for making decision rules;
• Compare leading procedures based on statistical arguments;
• Assess the performance of a decision rule;
• Apply these key insights into class activities using a statistical software.

Contenu de l'enseignement :

The course introduces usual classification methods and provides the basics of statistics for managing the risk of decision errors. The presentation of the statistical theory is reduced to its essentials in 2 hour lectures, one for each of four topics. For each lecture, 3-hour class activities consisting in solving standard problems using a free data analysis software (R, see r project.org) is privileged.

Lectures:

1. Significance of an effect on a group membership
2. Prediction of a group membership from a multivariate profile
3. Selection of most relevant risk factors
4. How to control the risks of decision errors?

Computer lab:
The lectures all take place in a computer room, in order the favor the straightforward illustration of new statistical concepts by their implementation in case studies in animal and plant science, consumer science, …. The only statistical software used for data analysis is R.

Case study:
For each lab session, new issues in animal or plant science, agrifood industry, consumer science, … are introduced with corresponding data.

Modalités d'évaluation :

1h written exam (all documents freely available) presenting a case study in which questions are inserted to evaluate the ability of the student to make the right methodological choices, fit a decision rule from data and assess its performance.

Volume horaire : 25.00 heures

Enseignant(s) responsable(s) : C. Guérin, V. Lechevalier

Langue d'enseignement : Français

Objectifs :

Connaissance des filières (aspects techniques, économiques, sociologiques) 

Contenu de l'enseignement :

L’enseignement essentiellement constitué de cours magistraux présentera les produits des filières suivantes :

• Le lait et les produits laitiers (11h) : composition et microbiologie du lait matière première, laits de consommation, laits fermentés, fromage, crème et beurre.
• La viande et les produits carnés (5h): biochimie du muscle et transformation du muscle en viande, stabilisation de la viande (réfrigération et cuisson), produits de charcuterie.
• Les œufs et les ovoproduits (8h) : structure et composition de l’œuf de poule, critères qualitatifs, valeur nutritionnelle, propriétés techno-fonctionnelles, technologie de fabrication des ovoproduits, microbiologie de l’œuf et des ovoproduits.

Modalités d'évaluation :

Examen individuel écrit (1h)

Volume horaire : 25.00 heures

Enseignant(s) responsable(s) : C. Guérin, V. Lechevalier

Langue d'enseignement : Français

Objectifs :

Connaissance des filières (aspects techniques, économiques, sociologiques)

Contenu de l'enseignement :

L’enseignement essentiellement constitué de cours magistraux présentera les produits des filières suivantes :

• Biochimie et technologie des céréales appliquées à la panification - biscuiterie (8h) : les constituants de la farine (amidon, gluten), bases de la panification et qualité du pain ; les procédés spécifiques de la biscuiterie.
• Biochimie et technologie des fruits et légumes (10h) : conservation des fruits et légumes sous atmosphère modifiée, technologie en brasserie, technologie des jus de fruits, technologie de vinification
• Biochimie et technologie des ingrédients d’origine végétale (6h) : matières grasses, sucre

Modalités d'évaluation :

Examen individuel écrit (1h)

Volume horaire : 25.00 heures

Enseignant(s) responsable(s) : C. Guérin, V. Lechevalier

Langue d'enseignement : Français

Objectifs :

L’objectif de cette UC est de découvrir les contraintes d’une filière par le biais de la qualité, de la production au produit fini. 

Contenu de l'enseignement :

Le programme des cours est le suivant :

• Viticulture et réglementation
• Notions de terroirs viticoles
• Place des vignobles français sur le marché des vins
• Divers types de vinification
• Œnologie : initiation à la dégustation

Modalités d'évaluation :

Examen individuel écrit (1h)

Volume horaire : 25.00 heures

Enseignant(s) responsable(s) : D. Causeur

Langue d'enseignement : Anglais

Objectifs :

In many scientific issues, especially in biostatistics, marketing or consumer studies, predicting a group membership raises many statistical challenges: how to learn a classification rule from data? how to assess the risk of a misclassification error? how to avoid optimism bias in the assessment of the prediction performance? The course provides elements to answer these questions. 

By the end of this course, students will be able to:

• Implement statistical methods for making decision rules;
• Compare leading procedures based on statistical arguments;
• Assess the performance of a decision rule;
• Apply these key insights into class activities using a statistical software.

Contenu de l'enseignement :

The course introduces usual classification methods and provides the basics of statistics for managing the risk of decision errors. The presentation of the statistical theory is reduced to its essentials in 2 hour lectures, one for each of four topics. For each lecture, 3-hour class activities consisting in solving standard problems using a free data analysis software (R, see r project.org) is privileged.

Lectures:

1. Significance of an effect on a group membership
2. Prediction of a group membership from a multivariate profile
3. Selection of most relevant risk factors
4. How to control the risks of decision errors?

Computer lab:
The lectures all take place in a computer room, in order the favor the straightforward illustration of new statistical concepts by their implementation in case studies in animal and plant science, consumer science, …. The only statistical software used for data analysis is R.

Case study:
For each lab session, new issues in animal or plant science, agrifood industry, consumer science, … are introduced with corresponding data.

Modalités d'évaluation :

1h written exam (all documents freely available) presenting a case study in which questions are inserted to evaluate the ability of the student to make the right methodological choices, fit a decision rule from data and assess its performance.

Volume horaire : 50.00 heures

Enseignant(s) responsable(s) : E. Beauchamp, V. Rioux

Langue d'enseignement : Français

Objectifs :

Cette UC vise à approfondir les connaissances des molécules biologiques (protéines et lipides), de leur métabolisme et de leur importance pour la santé. 

Contenu de l'enseignement :

Cette UC permet d’abord de renforcer les bases théoriques de la Biologie appliquée à la santé (métabolisme, enzymologie, lien avec les pathologies) et fait ensuite une large place à l’expérimentation pour étudier :

• l’effet d’un déséquilibre nutritionnel en lipides entraînant un dysfonctionnement métabolique préjudiciable pour la santé
• une protéine impliquée dans l’apparition d’une pathologie humaine. 

L'enseignement est divisé en 2 parties :

Partie 1 « Protéines et santé » (24h)

• Cours (6h) : méthodologies expérimentales en biologie des protéines (2h), mode d’action des enzymes (2h), régulations des fonctions cellulaires par les protéines (2h)
• Expérimentation (18h) : Extraction et purification d’une enzyme impliquée dans une pathologie humaine (xanthine oxydase). Les différentes méthodologies mises en œuvre sont la chromatographie d’exclusion et d’affinité, l’électrophorèse, l’immunoblot, le dosage d’activité enzymatique et la détermination de constantes enzymologiques.
• Interprétation des résultats obtenus et méthode de rédaction d’un article scientifique

Partie 2 « Lipides et santé » (24h)

• Cours (4h) : méthodologies expérimentales en biologie des lipides (2h) et digestion des lipides (2h)
• Expérimentation (18h) : Trois régimes sont administrés à des rats pendant 3 semaines: un régime sans lipide (lipidoprive), un régime contenant de l’huile d’arachide et un régime contenant de l’huile de lin. Le métabolisme des lipides au niveau hépatique est ensuite analysé puis discuté sur la base des recommandations de l’ANSES (Agence nationale de sécurité sanitaire de l’alimentation) concernant les apports nutritionnels conseillés pour la population française.
• Analyse et interprétation des résultats obtenus (2h) 

Modalités d'évaluation :

Évaluation écrite personnelle sous la forme d’un article scientifique décrivant les résultats expérimentaux.

Volume horaire : 50.00 heures

Enseignant(s) responsable(s) : F. Val, C. Bissuel, C. Le May

Langue d'enseignement : Français

Objectifs :

L’objectif de cette UC est de montrer comment la connaissance de la biologie et de l’écologie des différents bioagresseurs et de la physiologie des plantes cultivées permet d’établir le diagnostic agronomique et phytosanitaire d’un système biologique pour :

• le comprendre,
• hiérarchiser les facteurs limitants,
• mieux le piloter,
• y apporter des mesures correctives si nécessaire.

Contenu de l'enseignement :

Introduction à la notion de diagnostic agronomique et phytosanitaire : concepts, démarche et usage (2h)

1^re partie : Acquisition de connaissances (cours + conférences +TD/TP : 30h)

• Biologie des bioagresseurs (ravageurs et agents pathogènes)
• Écophysiologie des plantes cultivées : indicateurs de développement des plantes et de fonctionnement du couvert végétal face à un stress biotique ou nutritionnel

2^e partie : Mise en œuvre d’une démarche de diagnostic in situ à partir de l’étude d’un cas réel à l’échelle d’une parcelle cultivée et de son environnement (16h ou 18h)

• Sur le terrain : dans des parcelles cultivées, mesures in situ pour évaluer les facteurs limitants (bioagresseurs ou nutritionnel) d’une culture et échantillonnage.
• En laboratoire sous forme d’ateliers : analyse des échantillons récoltés : identification de bioagresseurs, évaluation des symptômes, analyse des impacts sur les composantes de rendement….
• Analyse et synthèse des résultats de la situation étudiée (travail inter-ateliers)
• Identification des points techniques à améliorer afin de proposer une solution adaptée

Conférences de clôture 2h ou 4h (en fonction des intervenants)

Modalités d'évaluation :

Évaluation individuelle sous forme d’un écrit (2/3 note) et par groupe à l’oral (1/3 de la note) 

Volume horaire : 50.00 heures

Enseignant(s) responsable(s) : P. Legrand, V. Rioux

Langue d'enseignement : Français

Objectifs :

• Acquisition des connaissances et raisonnements nécessaires pour appréhender la nutrition humaine dans ses aspects cellulaires et moléculaires fondamentaux.
• Compréhension des aspects physiopathologiques liés à la nutrition.
• Étude des causes et facteurs (étiologie) des grandes pathologies nutritionnelles (obésité, maladies cardio-vasculaires, diabète, syndrome métabolique…).
• Problèmes de santé publique liés à la Nutrition. 

Contenu de l'enseignement :

Cette UC est composée de cours magistraux :

1. Besoins nutritionnels de l’homme, généralités
2. Physiologie du comportement alimentaire
3. Besoins énergétiques de l’homme
4. Besoins azotés
5. Besoins en acides gras
6. Besoins en eau
7. Besoins en minéraux
8. Besoins vitaminiques : liposolubles (ADEK), hydrosolubles (Bs, C)
9. Métabolisme intermédiaire
   a) Principales voies métaboliques
   b) Profil métabolique des principaux organes
   c) Régulation du métabolisme
10. Exemples d’adaptation métabolique : jeûne, naissance, sevrage, diabète de type 1
11. Bases moléculaires de l’obésité et syndrome métabolique
12. Bases moléculaires des maladies cardio-vasculaires

Modalités d'évaluation :

Évaluation individuelle, examen final écrit, synthèse (2h)

Volume horaire : 50.00 heures

Enseignant(s) responsable(s) : J. Faure, C. Disenhaus

Langue d'enseignement : Français

Objectifs :

• Comprendre et appréhender les différentes positions de la société, ses attentes sur les sciences et productions animales
• Montrer comment les filières animales les prennent en compte et y répondent
• Permettre aux étudiants agronomes de porter un regard citoyen/consommateur sur les sciences et productions animales. 

Pré-requis :

L'UC est décomposé en 3 séquences : une séquence de « tronc commun », une séquence
« travaux pratiques » et une séquence transversale avec projets Les principes et bases théoriques
seront abordés sous forme de cours et/ou de ressources en ligne. Une ou plusieurs visite(s) viendront
illustrer ces approches.

Thématique d’enseignement de tronc commun :

1. Introduction : acceptabilité sociale de l’élevage. Définitions
2. Réglementation française et européenne aux niveaux de l’élevage, de l’animal et du produit : acteurs et processus ; réglementation sanitaire ; environnementale et bien-être animal (expérimentation, élevage, abattage).
3. Limites et avantages environnementaux de l’élevage (méthodologies développées et TD)
4. Concurrences et synergies territoriales
5. Filières, produits et labellisations : de l’animal aux produits
6. Vie d’animal/vie d’éleveur : la relation Homme animal en élevage
7. Communication des filières animales

Travaux pratiques :
Par groupe, vous devrez mettre en place un protocole expérimental pour étudier certains comportements des animaux en élevage (enregistrement de paramètres comportementaux dans des fermes expérimentales, sur modèles porcs, vaches et chèvres laitières) et appréhender les relations comportement-bien-être. 

Projet :
À partir d’une thématique d’actualité, vous devrez produire un support de communication adapté pour sensibiliser et éduquer le citoyen sur les questions touchant les animaux et l’élevage.

Modalités d'évaluation :

Examen final d’évaluation individuelle d’1 h qui vient compléter la note obtenue à l’issue de la séquence « travaux pratiques » et « projet ».

Volume horaire : 25.00 heures

Enseignant(s) responsable(s) : S. Gouin

Langue d'enseignement : Français

Objectifs :

Comprendre et relier les outils d’analyse entre le marketing et la gestion de la production afin d’améliorer les performances industrielles et créer de la valeur ajoutée au produit (gestion catégorielle, réponse efficace aux consommateurs …)

Contenu de l'enseignement :

Cette UC met en relation les outils d’analyse et de compréhension des marchés alimentaires en termes de marketing et de gestion de la production. L’ECR, le supply chain management, le category management sont appréhendés dans la perspective de décisions stratégiques et commerciales des IAA. De nombreux exemples et études de cas sont présentés par des professionnels (PJD, Procter et Gamble etc.)

Modalités d'évaluation :

Évaluation par équipe sur la base d’un dossier thématique à partir de recherche bibliographique et entretiens auprès de professionnels. 

Volume horaire : 25.00 heures

Enseignant(s) responsable(s) : C. Le Floch-Fouéré

Langue d'enseignement : Français

Objectifs :

• Acquérir des connaissances élargies sur la gestion industrielle et la Supply Chain
• Concevoir une approche globale de la gestion des opérations, de la planification à long terme jusqu’à l'exécution et la livraison des produits et services associés

Contenu de l'enseignement :

• Introduction à la gestion de production et à l’entreprise agroalimentaire
• La gestion des nomenclatures et des gammes de fabrication
• Planification et ordonnancement
• La gestion des approvisionnements et des stocks dans le flux de production

Modalités d'évaluation :

Évaluation via des études de cas

Volume horaire : 25.00 heures

Enseignant(s) responsable(s) : F. Husson

Langue d'enseignement : Français

Objectifs :

Rendre les étudiants autonomes dans la construction et l'analyse de plans d'expériences classiques.

Contenu de l'enseignement :

• Rappels sur le modèle linéaire : Régression simple et multiple et analyse de variance à k facteurs croisés
• Intérêt de la planification expérimentale
• Plans complets : Propriétés, choix d’un modèle
• Plans fractionnaires : Détermination et/ou choix des confusions entre facteurs ; choix d'un plan complémentaire ; dépouillement
• Plans pour facteurs qualitatifs à nombre quelconque de modalités
• Plans pour facteurs quantitatifs : plans composites centrés ; plans de Box-Behnken ; analyse d'une surface de réponse
• Plans optimaux

Modalités d'évaluation :

Examen écrit sans documents ni calculatrice.

Volume horaire : 25.00 heures

Enseignant(s) responsable(s) : F. Husson

Langue d'enseignement : Français

Objectifs :

L'objectif de cette UC est de présenter les principales méthodologies statistiques utilisées en analyse sensorielle allant de la planification du recueil des données sensorielles jusqu'au traitement statistique des données.

Contenu de l'enseignement :

• Planification de séances de dégustation (maîtrise de l'effet du rang, de l'arrière-effet d'un produit, etc) : construction de plan en Blocs Incomplets Equilibrés, de plans optimaux, de plans équilibrés pour les voisinages
• Performance d'un jury ou d'un juge (répétabilité, reproductibilité, interaction juge-produit, etc.) : analyse de variance à effets aléatoires et mixtes.
• Construction d'espaces produits - stratégies multidimensionnelles : ACP, positionnement multidimensionnel
• Relation entre préférences de consommateur, évaluations d'experts, données techniques et physicochimiques : cartographie des préférences, segmentation des consommateurs

Modalités d'évaluation :

Évaluation écrite

Volume horaire : 25.00 heures

Enseignant(s) responsable(s) : F. Husson

Langue d'enseignement : Français

Objectifs :

Rendre les étudiants autonomes dans la construction et l'analyse de plans d'expériences classiques.

Contenu de l'enseignement :

• Rappels sur le modèle linéaire : Régression simple et multiple et analyse de variance à k facteurs croisés
• Intérêt de la planification expérimentale
• Plans complets : Propriétés, choix d’un modèle
• Plans fractionnaires : Détermination et/ou choix des confusions entre facteurs ; choix d'un plan complémentaire ; dépouillement
• Plans pour facteurs qualitatifs à nombre quelconque de modalités
• Plans pour facteurs quantitatifs : plans composites centrés ; plans de Box-Behnken ; analyse d'une surface de réponse
• Plans optimaux

Modalités d'évaluation :

Examen écrit sans documents ni calculatrice.

Volume horaire : 25.00 heures

Enseignant(s) responsable(s) : A. Laperche

Langue d'enseignement : Français

Objectifs :

L’objectif de cette UC est de compléter les approches théoriques de la planification expérimentale par leurs applications dans le domaine de l’agronomie, d’amener l’étudiant à être capable de choisir et proposer un plan expérimental en fonction de la question agronomique qui lui sera posée et des contraintes auxquelles il sera confronté en tant qu’expérimentateur.

Contenu de l'enseignement :

L'enseignement est réparties en :
- Cours magistraux : Présentation des caractéristiques des principaux plans d’expériences utilisés en
agronomie et leurs principes d’analyse (6h)

• Les dispositifs en blocs complets :
• Les plans à un facteur : Dispositif en blocs de Fisher, carré latin,
• Les plans à deux facteurs : plan factoriel, split-plot, criss-cross
• Les dispositifs en blocs incomplets : lattice et alpha-plans

- TD : Analyse de données obtenues pour les différents plans avec R (10h)
- Visite d’essais dans le centre INRAE du Rheu (2x4h)

Modalités d'évaluation :

Examen écrit sans documents ni calculatrice (1h).